《灵剑尊》是由索以文化制作的3D动画。根据同名小说《灵剑尊》和漫画《灵剑尊》改编。该动画讲述了落魄少年楚行云立志要改变现状奋发图强创造一片新天地的故事 大梦一场，落魄少年立志要改变现状奋发图强创造一片新天地。珍奇异宝，功法武决，遗失的强者洞府，在这个天才辈出，充满挑战和机缘的时代，且看落魄少主如何闯荡大陆、遭奇遇，成为叱咤风云的至尊天帝。以前的仇人，现在，绝不会放过！梦中的遗憾，现在，一定要弥补！待到灵剑长啸之时，天地三界，我为至尊！
萌田薰子是一名十五岁的女子高中生，同是也是一名四格漫画家。从很小的时候起，薰子就渴望着漫画家这一给读者带来快乐的职业，并且一直想着实现理想而方向努力前进着。怀揣着理想，薰子搬进了专门为漫画家提供住所的女子宿舍，在这里，薰子解释了一群志同道合的好友们。 个性开朗思想单纯的少女漫画家恋冢小梦、虽然表面看来十分正经害羞，但实际上却创作出了令人血脉喷张的工口漫画的色情漫画家色川琉姬、常常因为过于带入到自己所创作的角色中而惹出很多笑料的少年漫画家胜木翼，和这些同道中人们在一起，薰子每一天都向着理想又迈进了一步。
阴守护（私市淳 配音）出身于历史悠久的忍者世家，外表看起来呆头呆脑的他自然也继承了流传在家族血液之中的忍术。阴守护家世世代代都肩负着保护绀若家的责任，而阴守护要保护的，是绀若家的大小姐绀若优奈（中原麻衣 配音）。实际上，阴守护一直都非常真挚的喜欢着优奈，可是，家族传统让他只能够将这份心意深深的埋藏在心底。 阴守护和优奈就读于同一所学校之中，在这里，他们结识了很多有趣的朋友们——含着金汤匙出生的千金大小姐沢菓爱里（新谷良子 配音）、一心想要杀掉优奈但渐渐被阴守护所吸引的剑客真双津椿（小岛幸子 配音），会有怎样好玩的故事发生在这里呢？
美幸和夏实分别完成一年的研修重返墨东署。跟著，区内接连发生多宗案件。 先有葵双叶和赖子发现一批数量庞大的鎗械，继而发生交通灯神秘故障以及电话线不通的意外。 后来，眾人在一次捣破走私鎗械交易的行动中发现一隻光碟，可是，其中的资料却无法开啟。那时候，一名神秘人致电墨东署他在隅田河的桥上放置了炸弹……！
家出して行方不明となっている兄・巧美を探してある街にやってきた恒。兄を探すのは困難かと思われ、捜し当てるまで帰らないと決意する恒だったが、あっさり見つけてしまう。しかし再会した巧美は美国探偵事務所の所長となっていた。巧美は、実家に帰る気配は全くない。恒は、兄が帰らないならばと、美国探偵事務所に居座ることを決意する…。
