《灵剑尊》是由索以文化制作的3D动画。根据同名小说《灵剑尊》和漫画《灵剑尊》改编。该动画讲述了落魄少年楚行云立志要改变现状奋发图强创造一片新天地的故事 大梦一场，落魄少年立志要改变现状奋发图强创造一片新天地。珍奇异宝，功法武决，遗失的强者洞府，在这个天才辈出，充满挑战和机缘的时代，且看落魄少主如何闯荡大陆、遭奇遇，成为叱咤风云的至尊天帝。以前的仇人，现在，绝不会放过！梦中的遗憾，现在，一定要弥补！待到灵剑长啸之时，天地三界，我为至尊！
作品的主人公美少女斋藤枫香（中学二年级），梦想是“成为哥哥（大学一年级）的新娘！”因其身高（180cm）和左眼被长发遮住的造型，而总会令人联想到传说中的独眼巨人（Cyclops），这样的她被大家昵称为“斋枫（さいぷ～）”。这部作品讲述的就是有着“斋枫”昵称的枫香和朋友们的日常生活的故事。
来自卓塔利亚的多朵夫•罗多尔，一个孤独的旅行者，他骑着长腿猪四处游走，漫无目的，不知前往何方。孤独沉默之人，日记是最好的倾诉对象。他的笔尖记录下旅途中的见闻轶事，充满了超现实的瑰丽、梦幻、神秘的色彩。有时，他渴望在山丘上的城堡落脚，可山丘却变成巨大的青蛙蹒跚而去；有时他坐在午夜的咖啡厅内，浓郁的咖啡杯中竟跃出一条鱼；有时，一头巨熊充当幕布为孩子们放送电影，播洒欢乐；有时，他又看到修长的兔男乘坐电车，飞向月亮所在的夜空。 如梦如幻的旅途，没有终点……
美幸和夏实分别完成一年的研修重返墨东署。跟著，区内接连发生多宗案件。 先有葵双叶和赖子发现一批数量庞大的鎗械，继而发生交通灯神秘故障以及电话线不通的意外。 后来，眾人在一次捣破走私鎗械交易的行动中发现一隻光碟，可是，其中的资料却无法开啟。那时候，一名神秘人致电墨东署他在隅田河的桥上放置了炸弹……！
高中生日暮窦子（铃川纱由 配音）拥有看见其他人内心颜色的能力，她憧憬着同学作永君（高石明里 配音）身上亮丽的色彩。作永退学后，窦子在小镇的旧书店找到了她，并结识了同样拥有明亮色彩的少年影平路易（木户大圣 配音）。在窦子的提议下三人组成了乐队，开始创作起属于自己的歌曲。因音乐结缘的三人关系逐渐拉进，却也各怀心事：窦子一直隐瞒着自己“能够看见他人颜色”的秘密；作永向家人隐瞒了自己退学的事实，路易则瞒着母亲搞起了乐队…… 随着校园庆典的临近，从音乐中获得安慰与力量的三人，在日吉子老师（新垣结衣 配音）等人的帮助下，决定用人生的第一场演唱会直面真实的自己。
