《灵剑尊》是由索以文化制作的3D动画。根据同名小说《灵剑尊》和漫画《灵剑尊》改编。该动画讲述了落魄少年楚行云立志要改变现状奋发图强创造一片新天地的故事 大梦一场，落魄少年立志要改变现状奋发图强创造一片新天地。珍奇异宝，功法武决，遗失的强者洞府，在这个天才辈出，充满挑战和机缘的时代，且看落魄少主如何闯荡大陆、遭奇遇，成为叱咤风云的至尊天帝。以前的仇人，现在，绝不会放过！梦中的遗憾，现在，一定要弥补！待到灵剑长啸之时，天地三界，我为至尊！
秦牧天生凡体，历经考验成为天魔教教主，被延康国封为第一任太学博士。延康国叛乱之战中秦牧引来魔神，掀起浩荡风云，后随武可汗入楼兰黄金宫，一个人打遍圣宫无敌手。他返回延康,助国师平叛、造射日神炮，后得人皇传承成为新一代人皇。机缘巧合下秦牧得知自己的身世,借助道门小玉京等人帮助，开启道法神通改革的大世。
主人公园丁打算坐飞机去动漫乐园游玩，不料还未登机时却误入到了朵雅大陆。这个大陆是多元宇宙论中无限个宇宙集合中的其中一个。园丁见识到了美丽的朔月学院，地龙拉着的马车，天空中学员使用魔法决斗，对于游戏老玩家的园丁来说很快地适应和认知到了自己已经来到朵雅大陆的局面。
小森朱梨（内田彩 配音）是一个身高足足有一米八的健壮女孩，参加了校田径部的她是队内的种子选手，深得同伴和教练的信赖。虽然小森外表看上去不好接近，但实际上个性却非常善良，对于他人的请求，小森无论如何都无法拒绝，虽然这样的特质给她惹出了不少的麻烦，却也令她在不知不觉之中掌握了很多他人鲜少能够掌握的特殊技能。 一头金发看上去好像一个不良少女个性却意外的单纯的西鸟惠（小泽亚李 配音）、小森的青梅竹马，沉默寡言深藏不露的根岸真子（长绳麻理亚 配音）、同班同学大谷九郎（竹下礼奈 配音），每天和好朋友们在一起，快乐的日常就此拉开序幕。
泷口宵虽然是个女生，但是她长相俊美，举止也很潇洒帅气，所以被同学们称为「王子」。虽然宵也想象漫画里的女主角谈场恋爱，但是男生们都因为宵长得太帅气，所以没把她当成女生，所以宵很早就放弃谈恋爱了。可是有一天，宵认识了一个帅气的男生市村琥珀，琥珀是大了宵一岁的学长，他因为家里有钱，而且长得很帅，所以也被大家称为「王子」。琥珀第一眼见到宵就被她吸引，后来也常常找机会接近宵。宵一开始很讨厌这个举止轻浮的学长，但是后来渐渐发现琥珀的优点…
金阳原本是一个普通少年，有不少小毛病，但他有十分积极的心态、助人为乐的品格和不怕困难的勇气。一个偶然的机会，他参加了武当山太极学院夏令营，认识了年纪相仿的朱焰、蓝岳等人。校长静虚发给孩子们一些神奇的校徽，据说它与太极能量——元力息息相关。不料，此事被武当的千年对手影山得知。影山尊者发誓夺下武当山，派出手下不断刺探消息，骚扰攻击太极学院。金阳、蓝岳、朱焰等七位少年运用所学的知识，修炼的能量和“千年水滴”赋予的元力，与影山斗智斗勇，大家共同成长，逐步激发了内在的天赋，成为七彩“虹少年”。最终，他们和老师以及校长齐心合力，开启了真虹灵柱的能量，战胜了来犯的影山。
