舞台会设定在自横滨大街陷入混乱的那个事件以后的3个月，主人公之一的紫携手失忆少女初，再度以侦探的身份开启了他们的活动。究竟亚特为什么会把枪口对准奈斯？包裹着谜团的真相即将在今年夏天揭晓。
主角春日野悠和他的双胞胎妹妹穹在父母死于事故之后，来到了位于名叫奥木染的小村的祖父的家中，在那里开始新的生活。一边和不习惯的家务事奋战，一边还要照顾平时足不出户、什么事情都不会的妹妹穹，悠的生活变得异常艰辛。
在与昔日到访奥木染时认识的天女目瑛和依媛奈绪重遇、认识了新的朋友、和以前一样几乎没有变的城镇和人们。这令人怀念的回忆和温馨的环境，治愈着悠心中的伤痕。在这样的过程中，慢慢地发生了一些变化。儿时定下的只属于两个人的秘密约定以及所失去的重要东西的下落。还有，定下了这个地方的真正理由。很快悠注意到了对自己来说谁是重要的存在……
面对伤痕累累，一路蹒跚走过的她，悠要如何面对呢？在阳光灿烂的初夏天空下，故事，就这样开始了……
《水星领航员》改编自漫画家天野梢的同名漫画。背景设定在未来，彼时人类已将火星改造成九成被海水覆盖的宜居星球，并在星球上以水都威尼斯为范本建造了城市新威尼斯。作品讲述在新威尼斯驾驶小船带观光客游览城市的领航员们，一起工作、生活及与人邂逅的温情故事。 由于雅典娜声优川上伦子已于2011年去世，新作中雅典娜将由“炮姐”声优佐藤利奈配音。此前影片计划于今年冬季上映，受疫情影响推迟至2021年春季。
