知名舞台剧女演员牧树里这日收到怪盗基德的预告信：在26个字母的盘旋飞舞中，他来拜领无价的“命运的宝石”。毛利小五郎受到牧树里委托将信件分析，认为基德将在演出最后一晚前来盗取宝石，当晚他及柯南、小兰等人来到剧场，那里早有诸多警察守候。 令柯南吃惊的是，基德竟扮成工藤新一出现在众人面前，但他及众人方向不同的紧张过后，宝石并没被盗，柯南醒悟字母预告信与航班相关。而柯南、小兰、牧树里及其同事搭乘的前往北海道的飞机上，尚有一起杀人计划正被精心设计。
景云霄本是龙域大陆至高无上的轮回大帝，遭受他人暗算时，施展五转轮回决重生成为红叶镇景家的一名少年。利用前世记忆，景云霄帮助景家解决了黑龙寨之危，但爷爷景御风也因此伤重。无奈之下，景云霄只能肩负起拯救家人的重任，只身来到荒石城寻药。祸不单行，景家原本是百战国京都的世家，只因躲避战神府追杀，才来到红叶镇隐居。而景云霄的再度现身，恰恰引起了战神府的注意。为了斩草除根，战神府派出了杀手组织暗羽殿前往荒石城刺杀景云霄。另一边，景云霄为了取药，在潜龙大比之上力挫各方天才，勇闯千机宝藏赢得冰山美人穆诗诗的芳心，技惊四座的同时也与诸多门派结怨。而在前有门派寻仇，后有暗羽殿追杀的境遇下，景云霄如何保护家族，力挫强敌，俨然成了一个未知数……
