在防卫队长官·四之宫功的判断下，日比野卡夫卡逃过了被做成武器的命运，但依然处于被关押状态。在第三部队的新人们接到调动命令，纷纷赶赴各自要去往的新部队时，率领第一部队的最强者·鸣海弦出现在了卡夫卡面前。 鸣海表示不需要作为队员的卡夫卡，为了让他认可自己，卡夫卡必须直面“怪兽8号”那过于强大的力量。但与此同时，“怪兽9号”的威胁也在暗中逼近…
《胶囊计划》由来自各行业、具有成熟动画制作经验的专业团队，不限形式、风格完成独立短片创作。这是中国原创动画的一次探索，每部作品都是中国动画的一个创意脑洞。 第二季利用短片特点拓展了观众对于国产动画的想象，既有探讨科技意识的科幻片、也有聚焦女性自我表达于和解的成长片、更有对弱势群体的人文关怀片，画风更是囊括了国风水墨、吉卜力式绘本风、黑白高反差的复古风。
本作主人公冈部伦太郎（宫野真守 配音）是个患有严重中二病的大学生，自称为“凤凰院凶真”的他和伙伴们组成了“未来发明研究所”，在位于秋叶原的一个简陋实验室内进行各种古怪发明和调查。 2010年7月28日这天，冈部和青梅竹马真由理（花泽香菜 配音）一同去了科学讲义会场，在那里，他们遇见了天才少女牧濑红莉栖（今井麻美 配音）。让人意想不到的事情发生了，冈部在会馆楼道内听到一声惨叫，他闻声而至，发现了倒在血泊中的牧濑。冈部用手机短信将这件事告诉好友桥田至，这个举动，让世界都颠覆了。实验室里那个所谓的“未来道具”，竟然真的可以左右世界的进程，冈部自此成了孤独的观测者。 这一切都是命运石之门的选择。
讲述了埃莉安的冒险故事：埃莉安是伦布里亚统治者的小女儿，在父母被神秘咒语变成怪物后，坚韧不拔的她必须勇敢地踏上征程，去拯救她的家人和王国。
