吴大师训练了4位擅长幻影旋转术的幻影忍者，他们正在寻找4件威力无比的黄金武器，以维护世界和平。魔王加满都和他的骷髅军团紧随其后，企图夺走武器并统治世界。勇敢的幻影忍者们踏上征途，一路战斗，但最终魔王加满都利用4件黄金武器离开了幻影忍者王国。
话说在纽约市的下水道之中住着四只功夫高强的忍者龟,它们跟随着忍者师父—一只来自日本的超级大老鼠.一次偶然机会,它们救了一名正义的电视女记者,她也成为了唯一知道忍者龟藏身处的人....
高中生日暮窦子（铃川纱由 配音）拥有看见其他人内心颜色的能力，她憧憬着同学作永君（高石明里 配音）身上亮丽的色彩。作永退学后，窦子在小镇的旧书店找到了她，并结识了同样拥有明亮色彩的少年影平路易（木户大圣 配音）。在窦子的提议下三人组成了乐队，开始创作起属于自己的歌曲。因音乐结缘的三人关系逐渐拉进，却也各怀心事：窦子一直隐瞒着自己“能够看见他人颜色”的秘密；作永向家人隐瞒了自己退学的事实，路易则瞒着母亲搞起了乐队…… 随着校园庆典的临近，从音乐中获得安慰与力量的三人，在日吉子老师（新垣结衣 配音）等人的帮助下，决定用人生的第一场演唱会直面真实的自己。
阴守护（私市淳 配音）出身于历史悠久的忍者世家，外表看起来呆头呆脑的他自然也继承了流传在家族血液之中的忍术。阴守护家世世代代都肩负着保护绀若家的责任，而阴守护要保护的，是绀若家的大小姐绀若优奈（中原麻衣 配音）。实际上，阴守护一直都非常真挚的喜欢着优奈，可是，家族传统让他只能够将这份心意深深的埋藏在心底。 阴守护和优奈就读于同一所学校之中，在这里，他们结识了很多有趣的朋友们——含着金汤匙出生的千金大小姐沢菓爱里（新谷良子 配音）、一心想要杀掉优奈但渐渐被阴守护所吸引的剑客真双津椿（小岛幸子 配音），会有怎样好玩的故事发生在这里呢？
